Bienvenido SECHI , me alegra verte por aqui,

Pues.. lo que comentas la verdad que a mi colega y a mi nos pasa también y no se exactamente si es que dichos documentales están "mal" rodados o mal ripeados.

Concretamente hay con algunos sobre todo documentales , que hay escenas que se ven muuuuuuy bien, y otras casi hacen daño a la vista, como bien dices con películas como Avatar no pasa en absoluto en toda la peli.

Te has fijado si el problema es en escenas concretas o en todo el corto??? , has probado a utilizar la opción de Invertir 3D en el proyector??

La verdad que es una pena que el 3DXL no tenga opción de seleccionar profundidad como el 3D Vision en el PC, pero bueno, en el caso de la PS3, los juegos que tienen opción 3D, normalmente se puede ajustar la profundidad y algún que otro valor.